Visi SMAK Santo Hendrikus adalah sekolah katolik yang berkualitas, dinamis, dan responsif. Dalam upaya mendukung tercapainya visi tersebut, maka peserta didik perlu dibekali proses pembelajaran yang komprehensif dan aplikatif. Pengaplikasian dalam kehidupan nyata, perlu dikembangkan agar peserta didik dapat melihat dan mengalami langsung mengenai dunia industri di PT. Yakult Indonesia Persada dan Badan Pusat Statistik Surabaya untuk kelas XII MIPA dan PT. Yakult Indonesia Persada dan Universitas Dinamika Surabaya untuk kelas XII IPS. Dalam pembelajaran ini siswa dapat menerapkan pembelajaran komprehensif dan aplikasi teori pada bidang industri, menganalisis data statistik dalam upaya penerapan materi statistika di mata pelajaran Matematika, memahami perkembangan teknologi di Museum Teknoform Universitas Dinamika dalam kolaborasi mata pelajaran Matematika, Pendidikan Kewarganegaraan, Kimia, Bahasa Indonesia untuk MIPA dan kolaborasi Sosiologi, Sejarah Peminatan, Pendidikan Kewarganegaraan, Bahasa Indonesia untuk IPS.
